A Greifswaldi Egyetemi Könyvtárat 1456-ban alapították, jelenleg Németország egyik legrégebbi egyetemi könyvtára. Az egyetem protestáns képzőintézményként történő újraalapítása idejéből származó, 1604-es keltezésű, tudományos könyvek kézbesítéséről szóló szerződés igazolja, hogy az egyetemi könyvtár minden kar számára gyűjtött könyveket.
1648-1815 között, amikor Greifswald a Svéd Királysághoz tartozott, rendkívül nagy gyűjtemény maradt fenn a svéd művekből. Ebben az időben jelentős regionális és balti tudósok régi gyűjteményeit szerezték be. 1773 és 1815 között a könyvtár rendelkezett a kötelespéldányokra való joggal a svédországi és a mai balti államokbeli kiadványokra. Az orosz fennhatóság idején, 1815-1945 között, Pomeránia kötelespéldányaira kizárólagos joga volt a könyvtárnak. Ezért a Pomerániai Különgyűjtemény gyarapítása a másik fő feladata lett a könyvtárnak. Továbbá a könyvtár és a helyi tudományos közösségek közötti szerződés alapján jelentősen gyarapodott az állomány, amely növelte a könyvtár helyi jelentőségét.
A könyvtár megőrizte azt a funkcióját, hogy különös figyelmet szenteljen a skandináv és balti országok kiadványaira. 1998-ban Greifswaldi Egyetemi Könyvtár felhatalmazást kapott arra, hogy gyűjtse a balti államokról szóló németországi nyomtatott és digitális kiadványokat. Jelenleg az egyik legfontosabb információforrásként szolgál a balti és észak-európai tudományokhoz. Digitális szolgáltatásai között, speciális balti információs forrásokat kínál a Vifanord virtuális könyvtárban.